在临床上，有不少发生在男女性外阴部和肛门部位的皮肤损害，或男性龟头发炎与尖锐湿疣有某些相似之处，常被误诊为尖锐湿疣，给患者造成极大的精神压力、恐慌，从而影响正常的学习和工作，影响夫妻间的感情及家庭的正常生活。若再加上不正确的治疗，就会给患者身心健康造成损伤和痛苦，同时给患者造成经济上的重大损失。在被误诊为尖锐湿疣的一些损害或疾病中多见的是女阴假性湿疣和男性龟头发炎等病症。
这些病症误诊为尖锐湿疣不仅是在临床上，而且在组织病理学上也可能造成误诊，曾经病理学诊断为尖锐湿疣的标本，发现其中因龟头发炎的假性湿疣就占62.9%。造成龟头发炎误诊为尖锐湿疣的主要原因是在临床上尖锐湿疣表现不典型或在一些不典型病变中尖锐湿疣确诊较困难，以及临床医生对尖锐湿疣和/或对某些病变认识不足等。
